メガウェブは、新型コロナウイルス感染症の拡大防止のため一部施設、アトラクションの運行、営業時間を変更して、6月10日（水）より開館した。なお、今後も状況に応じて、運営内容の変更や休館の可能性があるとしている。
また、アトラクションの利用の際には、検温（37.5度以上は体験不可）、マスク着用、連絡先の記入を実施している。
＜開館時間の変更＞
- トヨタ シティ ショウケース／11：00～19：00（変更前 ～21：00）
- ライドワン／11：00～18：0（変更前 ～20：00）
- ヒストリ－ガレージ／11：00～19：00（変更前 ～21：00）
- ライド スタジオ／休館中（6／16～オープン）
＜新型コロナウイルス感染症拡大防止のための対策＞
◆来場者
- 検温（37.5度以上は体験不可）
- 体調不良の人は入場不可
- 消毒、洗面所での手洗い
- マスクの着用
- 2m程度の間隔を取る（同行者以外）
- 連絡先の記入
◆職員
- スタッフの健康管理（検温、手洗い、マスク。手袋の着用）
- 管内の清掃、消毒
- 換気
